Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms