Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms