Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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