Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF1Q13972 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms