Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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