Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
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SHROOM2Q13796 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
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SHROOM2Q13796 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
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