Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms