Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1R1AQ13522 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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