Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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SGCGQ13326 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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