Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPPAQ13219 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms