Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms