Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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