Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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