Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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