Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF5Q12774 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF5Q12774 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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