Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms