Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms