Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms