Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms