Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms