Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms