Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GOLGA3Q08378 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA3Q08378 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms