Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms