Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms