Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms