Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms