Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms