Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms