Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 WFDC13-201ENST00000305479 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 LINC00564-201ENST00000567258 1119 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 LINC01697-204ENST00000458316 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms