Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms