Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms