Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BGRP55822 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms