Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms