Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
AFDNP55196 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
AFDNP55196 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFDNP55196 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFDNP55196 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFDNP55196 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFDNP55196 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms