Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOSBP53539 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms