Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEK4P51957 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEK4P51957 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms