Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LUMP51884 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LUMP51884 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms