Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX2P50458 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX2P50458 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms