Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms