Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTBP49356 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FNTBP49356 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FNTBP49356 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms