Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms