Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTRNP46939 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTRNP46939 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTRNP46939 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UTRNP46939 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms