Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP5P45974 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP5P45974 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP5P45974 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP5P45974 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms