Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATA4P43694 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATA4P43694 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATA4P43694 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms