Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CRATP43155 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRATP43155 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRATP43155 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms