Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPOP42166 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms