Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms