Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms