Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THBS4P35443 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THBS4P35443 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms