Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-FP30511 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms